UGENE — это свободное ПО для работы молекулярного биолога.

UGENE отлично работает на Windows, Mac OS, Linux и очень прост в установке и использовании. Обладает русскоязычным интерфейсом.

Функциональность

• Множественное выравнивание последовательностей на основе MUSCLE 3,4 и KAlign;
• Анализ с помощью скрытых марковских моделей, основанный на HMMER 2 и HMMER 3;
• Дизайн ПЦР-праймеров с помощью Primer 3;
• Предсказание вторичной структуры белков с помощью GOR IV и PSIPRED;
• Филогенетический анализ с помощью Phylip;
• Поиск сайтов рестрикции;
• Моделирование экспериментов генной инженерии;
• Сверхбыстрый поиск простых и тандемных повторов;
• Выравнивание ридов на референтную последовательность с помощью Bowtie;
• Сборка контигов с помощью CAP3;
• Анализ сайтов связывания транскрипционных факторов на основе SITECON;
• Поиск открытых рамок считывания;
• Обратная трансляция белков;
• Выравнивание последовательностей с помощью алгоритма Смита-Ватермана;
• Поддержка внешних инструментов: BLAST, ClustalW, MAFFT, T-Coffee;
• Обозреватель сборок — визуализатор данных в формате BAM.

• Простая и удобная работа с последовательностями;
• Визуализация хроматограмм;
• Редактор множественного выравнивания;
• Просмотр трехмерных моделей PDB и MMDB с поддержкой стерео-режима;
• Просмотр филогенетических деревьев;
• Конструктор вычислительных схем автоматизирующий процесс анализа;
• Поддержка сохранения изображений в векторные форматы для удобства публикации.

• Полная поддержка современных многоядерных процессоров;
• Встроенная поддержка вычислений на графических ускорителях;
• Вычисления на процессоре Cell Broadband Engine;
• Поддержка облачных вычислений: запуск вычислительных задач на Amazon EC2;
• Суперкомпьютерные и распределенные решения.

• Наш продукт может быть использован для обучения в университетах и институтах;
• Новая функциональность разрабатывается по запросам пользователей;
• Команда готова к работе над совместными проектами, как открытыми, так и коммерческими.

Unipro UGENE является свободным программным обеспечением, распространяемым по лицензии GNU GPL.

Установочные пакеты для различных операционных систем располагаются в разделе "Файлы".

С нами можно связаться для обсуждения возможного сотрудничества.